MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus brevis ATCC 367 plasmid 2

Total Repeats: 325

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008499	CAC	2	6	9	14	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_008499	A	6	6	39	44	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008499	ATA	2	6	145	150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008499	AGTT	2	8	337	344	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008499	T	6	6	343	348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008499	CAA	2	6	355	360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008499	GCT	2	6	368	373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008499	ATA	2	6	698	703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008499	AGTT	2	8	731	738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008499	TTG	2	6	748	753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008499	A	7	7	788	794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008499	AGC	2	6	805	810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008499	CAA	2	6	819	824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008499	CATTC	2	10	886	895	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_008499	AAC	2	6	896	901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008499	CAG	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008499	TGT	2	6	980	985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008499	ACA	2	6	1027	1032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008499	TTA	2	6	3192	3197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008499	GAG	2	6	3301	3306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008499	AAC	2	6	3371	3376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008499	TCA	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008499	ATTTA	2	10	3464	3473	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008499	AAG	2	6	3586	3591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008499	ACC	2	6	3622	3627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_008499	GC	3	6	3633	3638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008499	ATC	2	6	3737	3742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008499	TA	3	6	3758	3763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008499	ATT	2	6	3776	3781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008499	TGG	2	6	3879	3884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008499	ACT	2	6	4055	4060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008499	CAA	2	6	4137	4142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008499	AAG	2	6	4187	4192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008499	A	6	6	4218	4223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008499	TAA	2	6	4242	4247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008499	CAA	3	9	4264	4272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008499	CAA	2	6	4294	4299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008499	GAA	2	6	4336	4341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008499	AAC	2	6	4361	4366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008499	AAC	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008499	GTC	2	6	4554	4559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008499	T	6	6	4592	4597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008499	ATGT	2	8	4615	4622	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008499	ATT	2	6	4708	4713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008499	TAT	2	6	4783	4788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008499	T	6	6	4899	4904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008499	TGA	2	6	4933	4938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008499	GAA	2	6	4965	4970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008499	TTC	2	6	4989	4994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008499	TGA	2	6	5076	5081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008499	ATTA	2	8	5102	5109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008499	TGC	2	6	5117	5122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008499	TCA	2	6	5130	5135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008499	GAA	2	6	5168	5173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008499	ATGG	2	8	5227	5234	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008499	GTT	2	6	5514	5519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008499	GTT	2	6	5524	5529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008499	AGCC	2	8	5622	5629	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008499	TGC	2	6	5735	5740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008499	ACG	2	6	5753	5758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008499	CTA	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008499	ATTA	2	8	6035	6042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008499	CCT	2	6	6080	6085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_008499	CTT	2	6	7174	7179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008499	TATT	2	8	7190	7197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008499	GAT	2	6	7285	7290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008499	ATG	2	6	7317	7322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008499	TCG	2	6	7343	7348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008499	T	6	6	7358	7363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008499	TGT	2	6	7437	7442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008499	AAT	2	6	7555	7560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008499	CTT	2	6	7614	7619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008499	ATT	2	6	7636	7641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008499	AAG	2	6	7678	7683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008499	GTT	2	6	7942	7947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008499	A	6	6	7957	7962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008499	GATA	2	8	7993	8000	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008499	CAA	2	6	8011	8016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008499	AATAA	2	10	8017	8026	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008499	T	6	6	8088	8093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008499	GA	3	6	8750	8755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008499	T	6	6	8886	8891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008499	ATA	2	6	8899	8904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008499	TAAA	2	8	8977	8984	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008499	ATT	3	9	8985	8993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008499	AGCA	2	8	9002	9009	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008499	AAAGT	2	10	9075	9084	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008499	TCA	2	6	10337	10342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008499	CAT	2	6	10368	10373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008499	ATT	2	6	10461	10466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008499	TGA	2	6	10519	10524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008499	TCG	2	6	10528	10533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008499	A	6	6	10633	10638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008499	T	7	7	10711	10717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008499	TCA	2	6	10799	10804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008499	TTA	2	6	10815	10820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008499	TA	3	6	10947	10952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008499	TAC	2	6	11030	11035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008499	TCA	2	6	11223	11228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008499	CTT	2	6	11240	11245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008499	GTT	2	6	11284	11289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008499	ACTTG	2	10	11299	11308	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_008499	CTGAT	2	10	11316	11325	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_008499	T	8	8	11336	11343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008499	T	6	6	11377	11382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008499	T	6	6	11487	11492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008499	CGTTT	2	10	11497	11506	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_008499	ACCT	2	8	11513	11520	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008499	TCA	2	6	11629	11634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008499	GTA	2	6	11643	11648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008499	GAT	2	6	11726	11731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008499	TTG	2	6	11733	11738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008499	TGA	2	6	11770	11775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008499	TAT	2	6	11849	11854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008499	A	6	6	11864	11869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008499	CTT	2	6	11889	11894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008499	TGA	2	6	11949	11954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008499	GTA	2	6	11957	11962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008499	ATA	2	6	11987	11992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008499	T	6	6	12091	12096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008499	TAA	2	6	12100	12105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008499	A	6	6	12104	12109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008499	T	6	6	12135	12140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008499	CTT	2	6	12211	12216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008499	TAA	2	6	12316	12321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008499	A	6	6	12320	12325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008499	TCAA	3	12	12355	12366	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008499	CA	3	6	12367	12372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008499	TA	3	6	12405	12410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008499	ACC	2	6	12413	12418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_008499	CAA	2	6	12435	12440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008499	ATG	2	6	12613	12618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008499	TCT	2	6	12675	12680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008499	TTC	2	6	12804	12809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008499	TTTC	2	8	12813	12820	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_008499	CCAG	2	8	12845	12852	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008499	TGC	2	6	12859	12864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008499	CTG	2	6	12885	12890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008499	GAT	2	6	12915	12920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008499	TTG	2	6	12935	12940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008499	GTG	2	6	13024	13029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008499	TTAAA	2	10	13104	13113	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008499	ATA	2	6	13120	13125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008499	TGA	2	6	13140	13145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008499	GAC	2	6	13161	13166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_008499	TCA	2	6	13185	13190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_008499	TTTC	2	8	13203	13210	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_008499	CTA	2	6	13231	13236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_008499	TTG	2	6	13260	13265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008499	ATTT	2	8	13295	13302	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008499	CAA	2	6	13305	13310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_008499	TTGA	2	8	13349	13356	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008499	T	6	6	13393	13398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008499	TTA	2	6	13414	13419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_008499	AGG	2	6	13437	13442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008499	T	6	6	13448	13453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_008499	CTA	2	6	16540	16545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_008499	TTC	2	6	18052	18057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_008499	ATC	2	6	18094	18099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_008499	ATA	2	6	18105	18110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_008499	TCAA	2	8	18941	18948	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
193	NC_008499	TAA	3	9	19273	19281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_008499	TCA	2	6	25749	25754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_008499	TAT	2	6	25807	25812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_008499	TCG	2	6	25853	25858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_008499	T	7	7	25892	25898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_008499	TGGAA	2	10	25924	25933	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
297	NC_008499	T	6	6	26333	26338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_008499	TGA	2	6	26395	26400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
299	NC_008499	GTT	2	6	26416	26421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
300	NC_008499	GTT	2	6	26427	26432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
301	NC_008499	T	7	7	26441	26447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_008499	T	6	6	26457	26462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_008499	CTT	2	6	26484	26489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
304	NC_008499	TGC	2	6	26507	26512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
305	NC_008499	ATC	2	6	26528	26533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
306	NC_008499	AAT	2	6	26538	26543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_008499	CAG	2	6	26639	26644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
308	NC_008499	ATT	2	6	26723	26728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_008499	AATC	2	8	26783	26790	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
310	NC_008499	TTA	2	6	26837	26842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_008499	TGA	2	6	26953	26958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
312	NC_008499	T	6	6	27029	27034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_008499	TTG	2	6	27045	27050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
314	NC_008499	ATC	2	6	27096	27101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
315	NC_008499	TTG	2	6	27115	27120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
316	NC_008499	AGCC	2	8	27143	27150	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
317	NC_008499	GATT	2	8	27761	27768	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
318	NC_008499	AAAG	2	8	27801	27808	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
319	NC_008499	GGT	2	6	27809	27814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
320	NC_008499	ATAA	2	8	28479	28486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
321	NC_008499	A	6	6	28577	28582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NC_008499	ATC	2	6	28692	28697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
323	NC_008499	TTA	2	6	33891	33896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_008499	TAC	2	6	33911	33916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
325	NC_008499	TAT	2	6	35374	35379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.